在農作物發生病毒性危害時，我們會用到殺菌劑，這時要根據不同類別的殺菌劑的不同性質、特點和作用方式選擇品種。
一是保護性殺菌劑，這類殺菌劑是在病原菌侵入之前用來處理植物或植物所處環境的制劑。需要在植物沒有接觸到病菌或病害發生之前噴灑，才能收到效果，如銅制劑（波爾多液）、硫制劑（石硫合劑）、代森錳鋅、代森鋅、克菌壯、堿式硫酸銅、可殺得、種子處理劑和土壤處理劑。
二是性殺菌劑，這類殺菌劑特點是具有內吸性，使用這類殺菌劑是在病原物已侵入植物體內或植物已經感病，此時施用于植物殺死病原物或抑制病原物生長發育，從而減輕或消滅植物病害。在植物發病初期用藥，效果會更好。