生物農藥，相對傳統我們使用的化學農藥，可以說是一種比較新型的農藥類型，它在功能上有差傳統農藥無可比擬的優越性，但是，在使用方法上，我們也要與傳統農藥區別對待。
因為多數生物農藥無內吸性、噴藥時一是要注意噴灑均勻才能起到良好效果。如白僵菌，必須將菌體均勻噴灑到害蟲身上，菌體不斷繁殖，逐漸破壞害蟲的生理機能，終使害蟲代謝紊亂而死亡。在旱地作物上使用，要盡量噴足藥液，使植物每個部位都噴濕噴透，防止漏噴，這樣才能達到防治目的。二是生物農藥作用緩慢。宜在害蟲低齡幼蟲期使用。許多硅物農藥殺蟲效果緩慢，差于噴后立竿見影的化學農藥，因此用藥時間應比化學農藥提前2-5天。如BT乳劑、白僵菌、蘇云金桿菌等，它們殺菌速度緩慢，一般噴藥后，害蟲3-5天才逐漸死亡。三是生物農藥貯藏的地點要求陰涼、干燥，避免受潮。如蘇云金桿菌、井岡霉素、赤霉素等。它們的特點是不耐高溫、不喇貯藏。容易吸濕霉變，失活失效，而且保存期不能超過2年。