據了解，一般而言，芹菜蚜蟲主要危害芹菜根部，在芹菜側根和須根上會呈現出大小不等的瘤狀根結，造成芹菜植株生長不良，矮小。
芹菜蚜蟲的繁殖能力強，一旦發生病害，一般的農藥對于防治芹菜蚜蟲很困難。為了及時的防治芹菜蚜蟲，農業人員應加強芹菜間的有效管理，同時，選用藥劑并正確進行施用，才能夠有效的防治芹菜蚜蟲。農業人員及時的清潔芹菜種植區域，防止芹菜蚜蟲的滋生，及時采用采用銀灰色薄膜覆蓋避蚜、黃板誘殺有翅蚜和放養天敵如瓢蟲、食蚜蠅、草蛉等可以直接吃掉蚜蟲；選用藥劑用40%樂果乳油1000倍液噴霧，20%甲氰菊酯（滅掃利）乳油2000-2500倍液，2.5溴氰菊酯（敵殺死）乳油2000-3000倍液，2.5%三氟氯氰菊酯（功夫）乳油2000-3000倍液，10%吡蟲啉（一遍凈）可濕性粉劑1500倍液，螨虱凈2000倍液，5%高效氯氰菊酯乳油3000倍液，50%辟蚜霧（抗蚜威）可濕性粉劑2000倍液，50%馬拉硫磷乳油800倍液，50%滅蚜松乳油、50%滅蚜1號乳油1000倍液，50%敵敵畏乳油1000倍液。大棚溫室內可用22%敵敵畏煙霧劑，每畝施用0.5千克，在傍晚進行密封大棚熏煙，可以有效的防治芹菜蚜蟲的發生。
在芹菜蚜蟲發生時，可在芹菜上撒施草木灰，將芹菜的葉片覆蓋為宜，在使用后3天，蚜蟲會全部消失，防治芹菜蚜蟲效果顯著。