番茄在雨后出現萎蔫，分為暫時萎蔫和萎蔫。番茄暫時萎蔫是由于失水量大于根系吸水量而引起的；番茄萎蔫是由于水分不能滿足植株的正常生長，直至整株枯死，從而，番茄出現萎蔫死棵的現象。
番茄在座果期，剛好處于水分和養分需求的旺盛時期，需要根部吸收足夠的水分及其養分，才能及時供應植株的生長。因此，由于雨水的溫度低于土壤是溫度，在雨后，番茄根部受冷，細胞組織會出現收縮，吸收水分和養分受到明顯的阻礙。所以，在雨水進入棚后，植株會出現大面積的萎蔫，尤其是在雨后天晴，陽光的強度增大，使番茄出現萎蔫的現象。
番茄雨后萎蔫死棵，采取有效的措施來解決，初進行藥劑灌根，有效的防止根部病害的發生，施用雷多米爾錳鋅600倍液或普力克600倍液，也可用琥乙磷鋁或安克錳鋅1000倍灌根1-2次，有效的防治番茄的疫病、莖基腐病和疫霉根腐病等。在番茄植株噴灌根靈1畝3瓶沖施，噴施細菌必清300倍液，3-4天一次，連噴2-3次。在番茄葉片病害區域噴施苯醚甲環唑1500倍液或百菌清600倍液，也可噴施大生或多抗霉素等。在葉面噴霧和灌根同時進行，為了有效的控制雨后侵染性病害的蔓延，減少死棵現象的發生。在棚內發現番茄雨后萎蔫死棵的及時摘除，帶離種植區域，有效的減少病害的擴散。在遇雨水天氣，應及時排水，采用良好的排水、通風系統，更好的促進番茄的生長發育，提高番茄的產量和品質。