柑桔小實蠅為雙翅目，實蠅科。幼蟲在果內取食為害，常使果實未熟就先枯黃脫落，嚴重影響產量和質量。除柑桔外，還為害芒果、番石榴、番荔枝、陽桃、枇杷等200余種果實。應采取有效的措施來進行防治。
高招防治柑桔小實蠅有：人工防治、果實套袋和防治。
人工防治柑桔小實蠅屬于全變態型，切斷轉換鏈都可降低下一代的繁殖系數。受害果園在落果期應及時落果，經常摘除樹上有蟲害果。處理方法有燒毀、水燙和深埋，具體操作方法：對蟲害果可采用進行集中燒毀或加石灰投入糞池漚浸，或用沸水水燙處理；或進行噴殺后深埋50cm以上。
果實套袋防治柑桔小實蠅，在果實幼果期尚未被蟲危害時，及時進行套袋，可以有效的防止成蟲產卵而造成危害。番石榴、楊桃果實可用薄膜套袋，芒果果實宜用無紡布套袋。果實套袋可以有效的減少多種病蟲的危害，提高水果的品質，能夠生產無公害的水果，值得推廣和應用。
防治柑桔小實蠅，首先進行土壤殺蟲處理，重點應放在受害嚴重的果樹樹冠下的土表層。一般5-8月為柑桔小實蠅成蟲的羽化高峰期，用50%馬拉硫磷乳油1000倍或50%辛硫磷800-1000倍噴灑果園地面，每7天噴一次，連續噴殺2-3次，殺滅入土化蛹的老熟幼蟲和出土羽化的成蟲。其次，采用噴劑噴殺處理，在柑桔小實蠅成蟲高峰期內，用90%敵百蟲800倍或80%敵敵畏800-1000倍對樹冠和果園周圍的雜草進行噴霧殺滅成蟲，噴殺時間為下午4-6時噴殺效果更佳。