辣椒死棵現象出現，很多人都會想到用藥劑灌根的方法，但是灌根要選對藥劑，因為苗期用藥灌根出現的問題出現的較多，嚴重的甚至因藥害死亡。辣椒苗期灌根為什么容易出現嚴重的藥害呢？
首先，必須了解辣椒苗子根系的特點。苗期根系幼嫩，根系尚未出現木質化的老根，抗藥能力差。這時的根系，就如植株上部的心葉，很多菜農知道噴藥時要避免噴灑到心葉上，卻沒想到根系也有這個問題。一旦用藥濃度過高，造成傷根，整個根系都會受到很大的影響，恢復困難。同時，土壤中農藥被吸附、分解、稀釋快，使用濃度應該比噴霧時略高，防治效果才好。
其次，灌根選用的藥劑要有針對性。要知道重點防治哪類病害，才能對癥選用適合的藥劑。灌根時，選錯藥劑就會造成不可挽回的損失。如果在灌根時選用克露和殺毒礬，而這兩種藥劑之中都含有代森錳鋅，混配使得濃度倍增，容易出現濃度過高造成藥害。
除了要施加藥劑以外，還可以施加生物菌肥，這樣也能預防辣椒死棵現象的出現，施加生物菌肥可以讓土地中有益微生物菌數量增多，還可以抑制到病原菌的繁殖，還能夠養根和促根，還能夠讓植株的抗病能力增加，讓植株更加茁壯。需要注意的是生物菌肥不要同殺菌劑同時施加，如果僅是防治辣椒死棵，那么要是已經施加了生物菌肥，就不用再使用藥劑灌根了。