病毒病是蔬菜的一大類病害，可以由種子、汁液、蟲子等傳播。病毒病一旦發生往往防治很困難，所以科技界提倡用苗防治病毒病。培養苗首先是選用培養篩除了病毒的植株或材料，速長法加高溫處理是常見的方法。其次是利用組織培養獲得大量苗木。苗因蔬菜體內無病毒，因此生長勢特別好，產量特別高，品質也好。應該指出的是苗子不可能永遠。隨著栽培時間的延長，自然界的蚜蟲、葉蟬、粉虱等傳毒害蟲會再把病毒傳到苗上。不能把種苗的根莖等無限期繁殖利用下去，因為病毒會在苗或材料栽培過程中傳播，成為有毒苗。苗要定期更換，已經使用過幾年的苗如的瓜、山藥等都需要更換新一批苗。
在栽培中我們提倡消毒。多是指某一階段，采用了消毒的某一種方式，并不是一定要達到完全消滅的水平，只是對病原物進行了殺滅。殺滅是相對的，多不能達到“完全”殺滅的水平。往往是保持在一個較短時間內，使病原物數量呈較少的狀態。
常見的真正消毒是醫療單位采用的方式。在食品生產過程中，也常對于培養基或培養原料進行。方式是用高溫高壓，達到一定時間就能達到消毒的水平。
雖然蔬菜生產中的消毒沒有醫療單位那么，但其是很重要的環節。菜農應該注意抓好種子的溫水浸種，苗木的藥劑噴灑，棚室的高溫悶棚等工作，為蔬菜提供一個好的生長環境打下病蟲害防治的基礎。