大棚內蔬菜病蟲害的防治越來越難，老病害加重發生，還會出現新型的病害，交錯出現，那么應該怎樣去防治呢，要從以下三方面來進行，才能把現階段的病蟲害防治。
，選擇品種要選良種，加之合理施肥，科學套作與輪作倒茬，清潔田園等措施加以改善。科學套作例如大蒜行間載白菜，能讓白菜軟腐病減少62.5%；白菜還可與韭菜間套作，可使白菜軟腐病的為害明顯減輕；玉米與辣椒間作，由于玉米的這印作用，辣椒日灼病進而病毒病比單作田減少72%；葡萄園里種黃瓜，可使葡萄褐斑病、霜霉病的發病率平均下降47.5%。
第二，使用生態防治的辦法。不同病害適宜的溫濕度不同，應依據不同溫室內的具體情況，科學管理控制溫濕度，盡量保持較低的空氣濕度，避免出現高溫高濕及低溫高濕的環境條件，溫度一般白天控制在20-25度，夜間13-15度，適溫范圍內，采取偏低溫管理。合理通風，適時澆水，改善光照條件等。其中還可以選擇以菌治菌的方式，比如哈茨木霉菌可以很好的防治蔬菜上立枯絲核病菌、鐮刀菌、腐霉菌等引起的病害。
第三，農藥防治蔬菜病蟲害的辦法。在熟悉病害種類，了解農藥性質的前提下，對癥下藥，適期用藥，講究施法，選用高效、低毒、農藥，把化學防治的弊端降到限度。
在進行蔬菜病蟲害防治時可以三方面同時進行，綜合預防才能達到的效果。