大豆想要防治根上的病蟲害，種子要占很大的原因，所以預防蟲害，要從選種開始做起。
大豆根部病蟲害主要有孢囊線蟲病、根腐病、根潛蠅、黑絨金龜甲、地老虎等，防治方法如下：
農藝措施：搞好大豆品種更換，避免長期種植單一品種，提高大豆自身的抗病，耐蟲能力；提倡機械化選種，以病粒、蟲食粒、雜草籽、雜質，減少病蟲侵害機會；適期播種，依據各地病蟲害發生情況；采取早播或延后播種的方法達到躲病避蟲的目的；及早耕翻，精細整地，盡量病殘體，減少害蟲越冬幾率。
化學防治對孢囊線蟲和根蛆重的地塊采取5%甲拌磷(Ⅱ)，配合“三壟栽培”播種方式隨種肥下地；還可采用種衣劑，按藥為1∶75比例包衣。35%甲基硫環磷、35%乙基硫環磷，按種子量0.5%拌種，其中應用5%甲拌磷還可兼治二條葉甲、薊馬、紅蜘蛛等苗期害蟲。大豆黑絨金龜甲、地老虎亦可應用上述方法；在根腐病重的地塊，采用50%多福合劑，按種子量0.5%拌種；在根部病蟲害混發區，可采取殺蟲劑、殺菌劑混合拌種。（