微生物殺蟲劑種類很多，按照微生物的分類可分為細菌、真菌、病毒、原生動物和線蟲等。目前，國內研究開發應用并形成商品化產品的主要有細菌類殺蟲劑、真菌類殺蟲劑、病毒類殺蟲劑。
細菌殺蟲劑
細菌類殺蟲劑是國內研究開發較早的生產量、應用廣的微生物殺蟲劑。目前，研究應用的品種有蘇云金桿菌、青蟲菌、日本金龜子芽孢桿菌和球形芽孢桿菌，其中蘇云金桿菌是有代表性的品種。
蘇云金桿菌是一種能產生伴孢晶體毒素，昆蟲寄主譜較廣的重要昆蟲病原菌，是一種胃毒性殺蟲劑。我國現已通過國家農藥行政主管部門注冊的Bt生產廠家近70家，年產量超過3萬噸，產品劑型以液劑、乳劑為主，還有可濕粉、懸浮劑。大量的試驗和實際應用表明，蘇云金桿菌對多種農業害蟲有不同程度的毒殺作用，這些害蟲包括棉鈴蟲、煙青蟲、銀紋夜蛾、斜紋夜蛾、甜菜夜蛾、小地老虎、稻縱卷葉螟、玉米螟、小菜蛾和茶毛蟲等，對森林害蟲松毛蟲有較好效果。另外，還可用于防治蚊類幼蟲和儲糧蛾類害蟲。
真菌殺蟲劑
真菌殺蟲劑是一類寄生譜較廣的昆蟲病原真菌，是一種觸殺性微生物殺蟲劑。目前，研究利用的主要種類有：白僵菌、綠僵菌、擬青霉、座殼孢菌和輪枝菌。
白僵菌白僵菌是我國研究時間長和應用面積的真菌殺蟲劑。從上個世紀60年代起，國內開始研究利用白僵菌防治林業害蟲松毛蟲和農業害蟲玉米螟，至70年代，已開發出固相培養和液固兩相生產方法和應用技術，并陸續建廠生產白僵菌粗產品，大面積防治松毛蟲和玉米螟。到在產品劑型上，目前我國已開發出粉劑、可濕粉劑、油劑、乳劑和微膠囊劑。目前，白僵菌的研究開發重點在工業化生產技術、質量標準體系、劑型和產業化技術等方面。我國白僵菌生產廠僅10家左右，企業規模小，采用的生產工藝多為固相淺盤、窗紗開放式培養，生產的產品質量不穩定，大多未能達到規模化生產，產品自產、自銷、自用。白僵菌的寄主很多，可防治對象有玉米螟、松毛蟲、多種金龜子、水稻葉蟬、飛虱、桑天牛、茶小葉蟬、茶毛蟲、大豆食心蟲和蚜蟲等，特別是對玉米螟和松毛蟲，已作為常規手段連年使用。
綠僵菌綠僵菌是一種廣譜的昆蟲病原菌，在國外應用其防治害蟲的面積超過了白僵菌，防治效果可與白僵菌媲美。我國研究開發綠僵菌起步晚，經過多年的研究開發在菌株選育、生產工藝、劑型和防治對象上已有長足進步。目前，重慶大學基因研究中心完成了殺蝗綠僵菌生物農藥的研制，取得了重要的研究成果，并完成了產品登記注冊，生產的產品已在國內多個省份示范試驗。
其他真菌除白僵菌、綠僵菌外，其他真菌也表現出了很好的殺蟲潛力。淡紫擬青霉能有效的防治柑桔、檸檬和馬鈴薯等多種作物根結線蟲，對大豆孢囊線蟲也有較好的防治效果。粉擬青霉、玫煙色擬青霉防治松毛蟲和溫室白粉虱均取得了明顯的效果。雙座殼孢菌可防治刺棉蚜，蠟蚧輪枝孢可防治蚜蟲、薊馬和白粉虱。
病毒殺蟲劑
病毒殺蟲劑是一類以昆蟲為寄主的病毒類群，雖研究開發比細菌殺蟲劑晚，但近年來發展迅速。應用比較普遍的有核型多角體病毒、顆粒體病毒和基因工程棒狀病毒。從1993年國內第1個昆蟲病毒殺蟲劑——棉鈴蟲核型多角體病毒完成產品注冊登記至今，已有十幾個產品獲得登記，包括：棉鈴蟲、斜紋夜蛾、菜青蟲、黃地老虎和茶尺蠖等，年產量約2000噸。