農用抗菌素屬于生物農藥的范疇，作為綠色的農藥，深受人們喜愛。使用比較普遍的有鏈霉素、井崗霉素、內療素、慶豐霉素、灰黃霉素、放線菌酮、滅瘟素等，都是當前應用較廣的主要抗菌素品種。
農用抗菌素具有藥效高，選擇性強，易分解，殘留毒害低，對人畜，不污染環境，來源廣，制法簡單，容易推廣等優點。目前許多國家都把使用抗菌素作為與病、蟲、雜草做斗爭的一項重要手段。近些年來，我國利用抗菌素防治農林花卉等植物病蟲害的工作也取得了很大的進展。如用新生霉素治蟲，濃度在0.015％時3天內就可殺死100％的蘋小卷葉蛾，對各種林木上的蚜蟲致死率亦高達85％至98％。
使用農用抗菌素，要根據不同的植物病害選擇適宜的用法。如對土壤傳染的植物病害，可用其作土壤消毒劑；對種子、苗木傳染的植物病害，可用抗菌素進行浸漬，如浸種、浸根、浸苗等，或苗床噴灑；對農林作物地上部分病害，可選擇適當時機進行植株噴灑；在果木上使用，主要將其制成油膏，用以防治細菌性潰瘍。抗菌素的施用濃度通常在100ppm以內，除果樹、林木外，很少超過200ppm。
為提高抗菌素的防病效果，常在使用抗菌素時加入某種增效劑和金屬離子。添加增效劑可促進抗菌素的展布和吸收，常用的增效劑有甘油和其他多羥基化合物。目前一般作為商品的農用抗菌素制劑中都加有190甘油。多羥基化合物有強烈的吸水作用，可以延長抗菌素的有效吸收期，并可促進植物葉表面角質層的水化作用，增強葉表的透水性能。添加金屬離子可使抗菌素生成絡合物，使藥效顯著提高。如添加1％至2％硫酸銅制成的復方內療素，可以延長藥劑在植物體內的存留期，增強植物的抗病力。現將幾種主要農用抗菌素介紹如下：
井崗霉素防治瓜類立枯病，可用20至100ppm液灌根。該農藥具有較強的內吸性，藥效長達20至35天，無藥害且毒性低。
灰黃霉素防治瓜類枯萎病，可用5％至10％膏劑涂莖部病處，每周涂1次，共涂3至5次；防治果木腐爛病，可用250ppm液花前噴霧。
慶豐霉素常用于防治麥類、瓜類和花卉的白粉病，可用50至150ppm液噴灑。
放線菌酮又叫農抗101，防治櫻桃葉斑病可用0.5至2ppm液噴霧。該藥內吸性強，在植物體內有效期長，容易產生藥害。該藥對人畜有毒，對皮膚及粘膜有刺激作用。使用時，不宜與堿性農藥混用。
鏈霉素用其50至100ppm液噴霧可防治作物的細菌性病害；用其50ppm液噴霧可防治細菌性軟腐病；也可用其50至100ppm浸植物種子30至60分鐘，防治細菌性病害。