玉米棒上的絲不斷發現黑穗的現象，有關專家指出，玉米幫黑穗主要是由病原孢子造成的需要緊急防治。
（1）品種老化，抗病性減弱，故選用抗病品種是經濟有效的措施之一。
（2）溫度過低，是誘發絲黑穗病的重要因素，故早春播種時避開低溫或提前覆蓋地膜，提高地溫，或在病害形成黑粉瘤未破裂時，及時摘除瘤體并適時深埋，減少病菌在田間擴散，降低病菌侵染機率。
（3）玉米絲黑穗病主要是由土壤傳播，實行3—5年以上輪作，降低土壤中的含菌量，施用的土雜肥應充分發酵，降低病菌含量。
（4）恰當的使用種衣劑是防治玉米絲黑穗病直接、經濟、有效的措施之一，美國衛福1：200種衣劑是目前國內市場上防治玉米苗期病害、地下害蟲、絲黑穗病和玉米叢生苗的藥劑，具有綜合防效好、性高的特點。
（5）合理密植，加強田間管理，促進植株生長健壯，增強其抗病害能力。總之，利用抗病品種，有選擇性的使用種衣劑和提高播種質量，加強田間管理就可以有效地控制玉米絲黑穗病的發生與危害。