農藥殺菌劑是目前農業市場較為流行的一種農藥品種，不同的殺菌劑產品可以不同的病害，基本可以分為以下四類：
種類一：保護性殺菌劑：
保護性殺菌劑主要作用方式是在施藥后，在植物表面形成一層藥膜，使病菌不能被侵染。此類殺菌劑對氣流傳播病菌尤為有效，如用波爾多液防治多種作物的霜霉病；對植物種子或幼苗進行處理，可防治種傳病害的侵染，如三唑酮拌種可防治禾谷類黑穗病；多菌靈浸蘸甘薯幼苗防治苗期病害；福美雙、多菌靈土壤處理可防治多種作物的土傳病害，如猝倒病和立枯病等。
種類二：鏟除性殺菌劑：
該類殺菌劑對病原菌有直接強烈殺傷作用，但在植物生長期植物不能忍受這類藥劑，因此只能在播種前用于土壤的處理、植物休眠期或者種苗處理使用。常見的有福爾馬林消毒帶菌種子，戊唑醇對小麥條銹病、白粉病使用方法得當有鏟除作用。
種類三：性殺菌劑：
在植物感病以后，可用一些非內吸殺菌劑，如硫磺直接殺死病菌，或用具有內滲作用的殺菌劑，可滲入到植物組織內部，殺死病菌，或用內吸殺菌劑直接進入植物體內，隨著植物體液運輸傳導而起作用的殺菌劑。常見的有多菌靈、托布津、春雷霉素、嘧菌酯百菌清等。
種類四：抗病激活劑：
該類殺菌劑對植物處理后，通過識別病原菌從而誘導植物全株抗病的物質即為植物的抗病激活劑。但這種藥劑不能直接呈現殺菌活性，而是在使用幾天后較長時間予以抗病，故不易產生抗性。常見的藥劑有草酸、苯并噻二唑、烯丙苯噻唑。
以上四大種類是對農藥殺菌劑的總體概括，不同農作物病害選用的品種也不相同。