在耕地上種莊稼，幾乎所有的措施都要通過土壤才能發揮作用，一個好的措施，不僅對作物好，對土壤也好，就會事半功倍；如果某些措施對作物有利，對土壤有害，不僅它在作物上的作用有限，還會影響土壤健康，使土壤出現“亞健康”、“病態”，甚至死亡。常見的耕地土壤病有以下10種：
⑴耕作層變淺。
在長期不深耕深松和機械耕作碾壓、踐踏條件下，耕地土壤耕作層由過去的20～30公分變為15公分左右，加之降雨、灌水沉實，“犁底層”位置上移并加厚，成為堅硬深厚的阻隔層，阻礙土壤水分、養分和空氣的上下運行，阻礙作物根系下扎延伸，土壤蓄水減少，抗旱性能下降，土壤養分有效性和作物營養狀況惡化。
⑵土壤有機質減少。
一是長期不施或少施農家肥，缺少秸稈還田，不種植綠肥，土壤有機質得不到補充；二是超量施用化學氮肥，以及超出土壤負荷的高產，頻繁的表土耕翻，則加劇了土壤碳的耗竭，致使土壤有機質含量減少。土壤有機質減少會引發土壤結構破壞和土壤板結，土壤肥力下降，土壤理化和生物性質惡化，土壤酸化和次生鹽堿化，土傳病害加劇，土壤凈化能力減退等。
⑶土壤板結。
由于耕地土壤有機質缺乏，以及不合理的耕作和灌溉，大量施用化肥，土壤酸化，土壤次生鹽堿化，破壞了土壤團粒結，致使土壤板結。土壤板結直接導致土壤-植物系統缺氧、缺水、缺肥，影響到土壤植-物系統的物質轉化和能量交換，甚至某些生理活動和生命代謝不能正常進行，或者終止，或者向有害方向轉化。
⑷土壤酸化。
由于長期過量使用生理酸性肥料和化學氮肥，土壤中的酸性物質不斷增加并積累，土壤中的鈣鎂等堿性物質被作物吸收利用或淋洗而減少，缺乏必要的補充調節，使土壤出現酸化現象。土壤酸化會加速土壤貧瘠化，土壤有害重金屬活化，土壤有害微生物特別是寄生真菌增加，土傳病害嚴重發生。
⑸土壤次生鹽堿化。
由于長期過量使用化學肥料，使土壤中的鹽分不斷積累，尤其是硝酸鹽積累更甚。這些鹽分隨土壤水分上行聚集到地表，形成土壤表層次生鹽堿化，土壤結構破壞，理化生物性質惡化，輕則影響種子發芽出苗，阻礙養分吸收，作物生長不良，重則造成植物生理干旱，營養障礙、鹽害、死亡。甚至失去農業利用價值。
⑹土壤營養失調。
在日常生產中不按農作物所需營養元素比例施肥，不搞測土配方施肥，盲目過量施用氮磷化肥，不施或少施有機肥和中微量元素肥料，造成土壤中氮磷富集，土壤中的鉀和硅及中微量元素耗竭，導致氮磷鉀比例失調，大量元素與中微量元素之間的營養比例失調，有益元素缺失，并導致土壤營養元素拮抗，有肥而無用。
⑺土壤污染。
由于農業系統外的“三廢”污染，農業系統內的過量使用化肥、農藥、農膜的殘留污染，未經處理的有機肥污染，以及有害病原物污染，時常會進入耕地土壤。當這些污染物殘留累積超出土壤自凈化能力后就會“溢出”，直接造成耕地土壤的重金屬、有機化合物和致病生物污染。耕地土壤被污染后，就會破壞土壤生態平衡，使土壤有益生物大量死亡，土壤生物種群減少，土壤理化生物性質惡化，土壤活性下降，土壤功能變差，嚴重污染者會使土壤喪失生產能力，失去農業利用價值。
（8）土壤侵蝕。
耕地土壤侵蝕主要表現有水蝕、風蝕和耕蝕。主要是坡地土壤墾殖過度，尤其是坡度大于15度以上的坡地，頻繁地表土耕作擾動，使水土流失。其次是墾后缺乏如坡改梯、水平溝耕作、植物籬等保護性耕作措施，而是隨意挖地耕翻，既造成耕蝕，又加劇了風蝕、水蝕。長期水土流失， 導致土壤沙化， 土層變薄，養分流失，保水保肥能力降低，土壤貧瘠化，耕地面積減少。
（9）土壤-植物系統病。
由于連續在同一塊耕地上種植同一種或同科作物，因作物根系分泌物和殘留物及某些病原生物在土壤中大量積累，使這塊耕地土壤成為有病土壤。加之該作物所需要的營養元素因連續被吸收而缺乏，不需要的營養元素在土壤中累積，致使土壤營養失衡。再是土壤微生物生態群落被破壞，土壤對“有害微生物”的凈化能力或抑制作用下降，有害微生物增多，有益微生物減少，生物性質惡化。“土壤-植物系統病”的根源在土壤，表現在作物，當有病的土壤遇到免疫力差的植物，即會以植物病的形式表現出來，生產上常叫做重茬病、連作障礙、再植障礙。
（10）設施農業土壤綜合癥。
在全年或季節封閉的高溫高濕環境下，加之高度集約化、高復種指數、高強度利用、高頻度人為干擾，過量施肥，過量用藥，過量灌水，過度耕作與踐踏等強烈的干擾和巨大壓力下，設施土壤健康急劇惡化。一般種植2-3年，就出現土壤結構破壞，土壤營養失衡，土壤酸化，土壤次生鹽堿化，土壤有害物質積累，土壤微生物種群多樣性和功能退化等一系列土壤病。4-5年時極為嚴重，病蟲害猖獗，生產成本增加，管理難度增大，農作物產量品質下降，甚至減產絕收，無法繼續進行設施種植，被迫放棄、換土或移棚。
耕地土壤一旦有病，作物就不能正常生活生長，對它施加的生產措施的作用和效果也會大打折扣。“保健耕作、保健施肥、保健灌水、保健輪作”，恢復或重建健康的土壤-植物系統，提高土壤-植物系統的抗逆能力和生產能力，可以輕松、快捷地防治耕地土壤病和植物病，減少生產資料投入，簡化生產環節，降低生產成本，提高產量質量，實現優質生產，進而達到高效的目的。