辣椒備受人們的青睞，特別是在長江中上游地區如四川、重慶、貴州、云南、湖南等省市，辣椒已成為人們一日三餐不可或缺的蔬菜，種植辣椒的農戶也越來越多。
由于不少種植戶對前期病害和蟲害沒有預防意識造成了土傳病害的盛行，辣椒的品質和產量均受到嚴重的影響，以下是辣椒主要的土傳病害，供大家參考。
病毒病
辣椒病毒病除危害辣椒外，還危害番茄、白菜、黃瓜等作物。露地栽培辣椒發生十分普遍，溫室栽培發生相對較輕。
花葉壞死型
病葉呈現明顯的濃綠與淺綠相間的花葉癥狀，部分品種葉片呈現壞死斑。
引起落葉、落花、落果，嚴重的整株死亡。
葉片畸形和叢簇形
發病期間葉片褪綠，出現斑駁、花葉、葉片皺縮、凸凹不平、變小、變窄、呈線狀，莖節間縮短，有時葉片叢生呈簇狀，植株矮化。
果實現深綠與淺綠相間的花斑，果小，變畸形，易落花、落果、落葉。
發生規律：病毒隨病殘體生活在土壤中，主要由蚜蟲傳播，預防蚜蟲是主要的防治措施。
防治藥劑：吡蟲啉、噻蟲嗪等防治蚜蟲藥劑，鹽酸嗎啉胍、寧南霉素等預防病毒病藥劑，要在未發現蟲和病時進行預防。
青枯病
主要在辣椒盛花期、初坐果期易發生，初期僅個別枝條的葉片或1張葉片的局部呈現萎焉，后擴展到全株。
主要表現為植株迅速萎蔫、枯死、莖葉仍保持綠色。
病莖外表癥狀不明顯，縱剖莖部變褐，濕度大時橫切面可見乳白色液溢出，有別于枯萎病。
預防為主：實行水旱輪作，深溝高畦種植，定植后用氧氯化銅800～1000倍液淋根部和噴灑植株等。
初期防治：發病初期72%農用鏈霉素或20%葉青雙800倍液澆，每株澆250毫升左右，隔7～10天1次，連用2～3次；或用康蕾多粘類芽孢桿菌藥液灌根，隔3～5天再澆1次。出現病株時應及時拔除，并在病窩周圍撒入適量生石灰，防止病菌蔓延。
其他根部病害
常見的有：莖基腐病、根腐病、疫病等。
莖基腐病
本病多在幼苗定植后發生 。莖基部發生暗褐色不規則病斑，向左右上下擴展，使莖基部皮層壞死，縊縮變細，地上部葉片萎蔫變黃，整株枯死。
根腐病
發生于定植后。初期病株枝葉特別是頂部葉片稍見萎蔫，傍晚至次日早晨恢復，癥狀反復數日后葉片全部萎蔫，但葉片仍呈綠色。
病株的根莖部及根部皮層呈淡褐色及深褐色腐爛，極易剝離，露出木質部；橫切莖觀察，可見維管束變褐色，后期潮濕時可見病部長出白色至粉紅色霉層。
疫病
幼苗發。呵o基部呈暗褐色縊縮，水浸狀，造成幼苗折倒和濕腐，而后枯萎死亡。葉發。撼霈F灰褐色邊緣不明顯的病斑，病葉很快軟腐脫落。
莖部發病：多在莖基部和分叉處，初期出現暗綠色水浸狀病斑，后擴大為不規則形黑褐色斑，病部凹陷、縊縮，染病上端枝葉由下向上枯萎死亡。
果實發病：初期果蒂部有開水燙狀、暗綠、邊緣不明顯病斑，使整個果實腐爛，逐漸失水成黑褐色僵果。
根系發。撼霈F褐色濕潤狀病斑，引起上部莖葉萎蔫死亡。潮濕時，病斑表面都可長白色霉狀物。
防治方法：重在預防，必須在未發病前進行施藥，而且要及時，次數頻繁。一般使用銅制劑、惡霉靈、多菌靈、甲基硫菌靈等藥劑的溶液進行灌根，在移栽時結合定根水進行使用，活棵后澆灌一次，花期前再澆灌一次，基本可以預防此病，當然多年重茬的地塊除外。