水生蔬菜主要有荸薺、藕、菱白、慈姑、菱、水芹等。水生蔬菜田雜草與旱地蔬菜田雜草不同，除旱改水的前幾年有部分鯉腸等濕生雜草外，主要有稗草、鴨舌草、異型莎草、瓜皮草、眼子菜、水莎草、扁稈草等水生雜草，在種類上與稻田雜草十分相似。
水生蔬菜抗藥性較強，防除稻田雜草的各種除草劑對它都比較。常用的除草劑有（雜草萌芽前使用）：
1.60%丁草胺乳油。每畝田75～100毫升，加水30公斤噴霧。
2.12%惡草靈乳油。每畝用125～150毫升，對水3O公斤噴霧。
3.10%農得時可濕性粉劑每畝15～25克，對水25公斤噴霧，防除闊葉雜草及一年生莎草科雜草，藥劑十分顯著。
4.農得時與丁草胺等殺稗藥劑混用（用量為各自的二分之一至三分之一），可防除水生蔬菜田幾乎所有的雜草。
注意事項：整田要求平整；除草劑施用時應保持2～3天的淺水層。