農藥的使用中細菌生物農藥是當前蔬菜無公害栽培重點推廣使用的新型保護藥劑。由于使用時天氣條件會直接影響到細菌性農藥中的細菌活性，從而影響效果，因此在使用時須特別注意天氣條件。
一、溫度
細菌生物農藥的活性成分是蛋白質晶體和有生命的芽孢。在低溫條件下，芽孢在害蟲體內繁殖速度慢，蛋白質晶體也不易發生作用。據試驗，在氣溫25～30℃時施用細菌生物農藥的藥效比在10～15℃時提高1～2倍。
二、濕度
細菌生物農藥中細菌的芽孢喜潮濕環境，因此，使用時田間濕度越大，藥效越高，尤其是噴施粉狀生物制劑農藥更應注意田間濕度。一般在清晨和傍晚有露水時噴施細菌粉劑，以利于菌劑較好地粘在作物莖葉上，并促進芽孢繁殖，提高藥效。
三、陽光
陽光中的紫外線對芽孢有殺傷作用。據試驗，陽光直射0.5小時，芽孢死亡率達50%左右；直射1小時，芽孢死亡率達80%。此外，紫外線輻射會使伴孢晶體變形降效。所以，噴施細菌生物農藥應在傍晚或陰天進行。
四、雨水
噴施細菌生物農藥后不久，如遇中到大雨，會將噴灑在作物莖葉上的菌液淋沖掉而降低藥效；但如果在施藥5小時后下雨，則不但不會降低防效，反而有增效作用。