韭菜是多年生宿根蔬菜，病蟲害較多，只有科學、、合理地使用農藥，才能有效地控制韭菜病蟲害的發生與危害。
一、蟲害
韭菜的主要害蟲是韭蛆。韭蛆嚴重危害著韭菜的生長，要根據實際情況，采取措施適時防治，主要防治韭蛆的方法：（1）成蟲。非蛆每年發生5-6代，春、秋季發生為嚴重。成蟲羽化期一般在4月、9月份。應選擇天氣晴朗的上午9-10點，每畝噴灑2.5%溴氰菊酯乳油2000倍液。（2）幼蟲。藥劑灌根，每畝用2%甲基阿維菌素乳油500毫升稀釋成1000倍液進行澆灌。
二、病蟲
夏季已經到來，雨水偏多，因此要加強防治韭菜危害的發生。韭菜的主要病害有灰霉病、疫病、紫斑病等。灰霉病發病初期葉片上產生白色或灰褐色斑點，后擴大成棱形或橢圓形病斑，互相愈合后成大片枯死斑使葉片枯死。潮濕時枯葉表面密生灰色至灰褐色霉狀物。病菌主要以菌核在土壤中病殘體上越冬，借氣流傳播。韭菜灰霉病全年危害。防治灰霉病采取的主要方法有：（1）用78%科博600倍液效果好；（2）增施有機肥，適當收割，雨后要及時排水，減少田間濕度；（3）及時去除老葉、病苗。
韭菜疫病危害根莖葉，尤以假莖鱗莖受害重。葉處受害字發為暗初色水漬狀病斑，后葉片變黃軟腐，莖、根部受害呈褐色軟腐，潮濕時病部產生稀疏白色霉狀物。病菌在土壤病殘體上越冬（溫室韭菜可常年發生），為高溫高濕性危害，適溫25-32℃，危害高峰期8月份左右。在病害發病初期，陰天的時間，可噴施50%灰核威1000倍液或40%菌核凈2000倍液防治，在每茬韭菜收割以后都要均勻的噴灑。在選擇藥劑的時候應注意選用高效、低毒、低殘留的新型殺菌劑，并要輪換交替施用。