配方施肥各法計算出來的肥料施用量，主要是指純養分。而配方施肥必須以有機肥為基礎，得出肥料總用量后，怎樣來分配化肥和有機肥料的用量呢？主要有以下幾種方法：
（1）同效當量法。由于有機肥和無機肥的當季利用率不同，通過試驗先計算出某種有機肥料所含的養分，相當于幾個單位的化肥所含的養分的肥效，這個系數，就稱為“同效當量”。例如，測定氮的有機無機同效當量在施用等量磷、鉀（滿足需要，一般可以氮肥用理的一半來確定）的基礎上，用等量的有機氮和無機氮兩個處理，并以不施氮肥為對照，得出產量后，用下列公式計算同效當量：
同效當量=（有機氮處理-無機氮處理）/（化學氮處理-無氮處理）
如：施有機氮（N）7.5公斤的產量為265公斤，施無機氮（N）的產量為325公斤，不施氮肥處理產量為104公斤，通過計算同效當量為0.63，即1公斤有機氮相當于0.63公斤無機氮。
（2）產量差減法。先通過試驗，取得某一種有機肥料單位施用量能增產多少產品，然后從目標產量中減去有機肥能增產部分，減去后的產量，就是應施化肥才能得到的產量。如有一畝田，目標產量為325公斤，計劃施用廄肥900公斤，每百公斤廄肥可增產6.93公斤稻谷，則900公斤廄肥可增產稻谷62.37公斤，用化肥的產量為262.63公斤。
（3）養分差減法。在掌握各種有機肥料利用率的情況下，可先計算出有機肥料中的養分含量，同時，計算出當季能利用多少，然后從需肥總量中減去有機肥能利用部分，留下的就是無機肥應施的量。
化肥施用量=（總需肥量-有機肥用量×養分含量×該有機肥當季利用率）/（化肥養分×化肥當季利用率）。