根據土壤的性質施用不同的肥料和采用不同的施肥方法叫因土施肥，基本的有效的方法有以下3點：
1、土壤的保肥能力和供肥特點對施肥效果影響很大。凡是土壤比較粘重，有機質含量比較多，保肥力比較強，即使一次施肥較多，養分也不至于流失。反之，土壤屬砂性，有機質含量較少，則保肥能力也相應較弱，在這種土壤上施肥，每次用量不宜過多，應采用少量多次，以免養分流失而造成浪費。但土壤的供肥特點也各有不同，有的肥勁長而穩，這種土壤是“飽得餓不得”，一次施肥可多些，次數可少些；有前勁而后勁不足的早發田，應注意作物的后期施肥；有后勁而前勁不足的晚發田，應注意早期施肥。
2、土壤中各種養分的多少，是決定該施哪種肥料、施多少的主要依據。土壤中的養分狀況，不僅與土壤成母質有關，還與前作物有著直接或間接的關系，一般來說，如前作是豆類作物或綠肥，土壤中的氮素就比較多，應該增施磷、鉀肥，如前作是禾本科作物如水稻或小麥等，則土壤中養分消耗就比較多，應該增施氮、磷、鉀肥，尤其是氮肥。
3、土壤的酸堿性會影響施肥的效果，而施用的化學肥料會影響土壤的酸堿性。酸性土壤應選擇堿性肥料，如氨水、碳銨、鈣鎂磷肥等，堿性土壤應選擇酸性肥料，如過磷酸鈣、硫酸銨等，這樣就可以避免土壤變得過酸或過堿，又有利于作物對養分的吸收利用。