土壤動物中占優勢的類群是蚯蚓、線蟲、蟎類、昆蟲，其中蚯蚓對土壤養分富集、提高肥力、疏松土壤、促根生長的作用是相當顯著的，線蟲、蟎類和食根昆蟲類則危害根系生長。而要想改善根系生長的土壤環境，必須從科學施肥和土壤生物的類群上下手。
改善土壤根系生長環境的措施需注意以下三個方面：
1、一要科學施肥，有機無機相結合，種地不忘記養地，保持持續的有機質投入為重要，這樣有利于土壤有益生物的繁殖，有利于培肥地力，有利于肥料利用率提高，有利于高產優質。
2、一要補充土壤有益生物數量，主要是有益微生物數量。如多粘類芽孢桿菌，本身它是一種細菌，通過該菌產生的廣譜抗菌物質和位點競爭，來殺滅和抑制病原菌，并能誘導植物產生抗病性，從而達到防治病害的目的。
3、三要殺滅和抑制有害生物數量。可使用一些高效低毒的、能分解的農藥殺滅和抑制地下害蟲（如用阿維菌素防治線蟲、用毒死蜱防治蠐螬、金針蟲等），對土傳病原菌的防治采取以菌治菌的方法，如白僵菌、多粘類芽孢桿菌等。