油菜施肥分為底肥和追肥，底肥施足了，才能為油菜的生長奠定良好的基礎，油菜追好肥，才能油菜高產。
油菜底肥的施用。一般每畝用堆肥1000-1500公斤、磷肥20-25公斤，在整地時混勻后耕耙入表土中，同時用豬糞水1500-2000公斤，兌入適量化學氮肥一起施入苗床土中，培肥床土。
油菜還需早施齊苗肥。當苗床80%秧苗出齊后，每畝澆施稀薄人畜糞尿水肥750公斤左右，或尿素4公斤左右兌水澆施，以防止油菜苗3-4葉期以后生長遲緩，葉片發紅。如果底肥足，秧苗生長旺盛，則不宜追肥，并應在4-5葉期煉苗，防止旺長和形成高腳苗。
增施磷鉀肥。基肥中磷鉀肥沒有施的或者土壤缺磷鉀元素嚴重的田塊，在油菜苗期更應注意增施磷鉀肥。一般畝施過磷酸鈣15-20公斤，或鈣鎂磷肥20-25公斤，苗床磷肥施了的，可以不必施磷肥，但可葉面噴施0.2%的磷酸二氫鉀肥液，鉀肥宜用氯化鉀或硫酸鉀在秧苗3葉期前澆施。
適施定苗肥。油菜定苗前后，畝用稀薄人畜糞肥水500-750公斤左右淋施2-3次。土壤干旱、苗瘦的可適當多施些，土濕苗壯的可少施些。4-5葉期以控為主，停止施肥澆水，進行蹲苗，防止苗床期發生徒長現象。
巧施送嫁肥。在油菜移栽前5-7天施一次少量氮肥，可每畝用碳銨7.5-10公斤兌水淋施。如果油菜秧苗葉色較淡，或出現老紅葉現象時，可結合噴施磷肥，一般用過磷酸鈣1-1.5公斤，用清水10公斤浸泡一晝夜后，取濾清液適當加清水噴施。
補施硼砂肥。油菜一生對硼素需求量較多，且十分敏感，油菜缺硼不僅會引起油菜生長后期的花而不實，而且對苗期影響也很大。因此在油菜苗期可結合追肥每畝用0.5公斤硼砂兌水澆施，如果此時秧苗已出現缺硼癥狀時，應用0.1%-0.2%濃度的硼砂肥液50公斤，進行葉面噴施，可以促使葉片轉為正常，效果明顯。