雨天會使西芹的光照不足，溫度降低，濕度明顯增加，病害加劇，西芹得不到光合作用的吸收，嚴重影響西芹的產量和品質。所以，在管理上需要多加用心，提前預防，減少不必要的損失。
在雨季應保護西芹的生長，溫度逐漸降低，冬天來臨，低溫的環境條件下，應及時的預防及控制病害的蔓延，實現西芹的高產增收。
西芹的斑枯病是常見的病變之一，斑枯病主要危害葉片，其次是葉柄和根莖。病斑初顏色為淡褐色的小斑點，之后擴散為各種形狀的斑，顏色由淺黃變為灰白色，西芹發病較重，連陰天、氣溫波動頻繁、夜間結露、植株長勢變弱、灌水較多，都會導致病害的蔓延。另外，要均衡施肥，底肥要施用腐熟的有機肥料，追肥中要施用磷、鉀，合理的施肥，在撒施一些葉面肥，增強植株的抗病性。及時病株，要及時，減少病源的擴散。
雨天防止部分植株伏于地面，影響植株的生長，要及時的管理，將植株直立后，在恢復正常管理。