為了能夠高效的增強微量元素肥料的肥效，在施用的時候應該注意如下幾個問題：
一、農作物對微量元素養分的反應。
各種類農作物對不一樣種類的微量元素養分有著不相同的反應，一般情況下應該選擇相對應的微肥施用在敏感程度比較高的農作物上。比如，一般油菜對硼元素比較敏感，施棚肥效果也是非常好。
二、土壤供應微量元素養分的能力。
土壤是不是缺少某種微量元素和母質及成土過程有關，并且微量元素的有效性受到很多條件的影響，特別是pH值影響為顯著。比如，土壤堿性將會使鐵、硼、錳、銅、鋅等元素的有效性降低，但是鋼的有效性卻有所增加。在具有酸性土壤上，土壤的酸性會提高鐵、錳、銅、鋅元素的有效性，而鋼的有效性卻非常低。因此，在施用微肥的時候應該有針對性。
三、配合大量元素肥料施用。
在農業生產的過程中農作物對大量營養元素需求量非常大，并且土壤中經常缺乏，需要及時補充，而微量營養元素僅僅在滿足農作物對大量營養元素需求的前提下，才將會有非常好的肥效。所以，微肥應該配合氮磷鉀肥料一起施用。