枸杞樹在各個生長時期所需的肥料不同，從萌芽到開花前主要應滿足枝葉生長對氮素的需要；在花芽分化、枝葉生長和果實生長發育高峰期，應以氮、磷、鉀肥配合施用較好。
追肥時期，應根據樹體生長結果情況而定。4月下旬至5月上旬是枸杞新枝葉生長和老眼枝花蕾形成期，需追頭次肥，主要用尿素，配合適量磷肥；6月初至7月底是一年中大量新枝生長、花蕾形成和開花結果高峰期，也是大量果實膨大生長盛時期，需要有充足的氮、磷、鉀肥，若肥料不足，就會影響生長和加重落花落果。如果8月上旬枸杞新枝生長多，并有不少花蕾，為了促進秋果生長，此時還應再追一次氮磷鉀肥。
為了緩解樹體養分不足的矛盾，從6月初開始，在整個花果盛期，每隔15—20天進行一次葉面追肥，對保花保果和提高產量有很好作用。
施肥量：枸杞施肥量應根據樹冠大小、長勢強弱及土壤性質等確定。一般施肥量是大樹比小樹多，弱樹比旺樹多，結果多的樹比結果少的樹多，瘠薄沙地比深厚肥沃的壤土多。因枸杞一年中生長結果期長，所以經常供給充足的肥水會更有利生長和開花結果，易得到高產、穩產。
施肥方法：枸杞基肥的施法，主要有環狀溝施、半環狀溝施和條狀溝施等三種。施肥溝挖好后，把基肥施入，均勻攤在溝內，與土拌勻，上面再填土覆蓋。根部追肥，一般采用穴施或溝施，即在樹冠邊緣下方，磷肥（過磷酸鈣、骨粉等）易同土壤中的鐵、鈣化合成不溶性的磷化物而被固定在土中，它不易被根系吸收。因此，對于磷肥宜在枸杞需肥前及時施入，或者把它摻在有機肥中施入，借助有機肥中的有機酸來增加其溶解度，便于根系吸收。葉面追肥，也叫葉面噴肥。此法簡單易行，用肥量少，肥效快，節省勞力，減少成本。
噴肥方法是：將氮、磷、鉀三元素肥料配成0.5％的水浸液，噴在樹冠上。葉面噴肥時間盡量選在陰天或在晴天上午ll點鐘以前及下午4點鐘以后進行，中午烈日時不要噴，以減少葉面蒸發，便于葉面吸收。雨天因淋洗嚴重，不宜噴肥。
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