很多菜農存在的一個錯誤認識，那就是認為煮熟的豆子當作基肥施加對作物非常有效，不會燒根，其實就是菜農們把煮熟與腐熟混淆了。
煮熟與腐熟一字之差，含義卻完全不同。煮熟是經過物理的高溫水煮處理，使蛋白質變性，豆子失去發芽能力；而腐熟則是經過多種微生物發酵分解，使豆子中的大分子蛋白質、卵磷脂等分解成為植物根系可以吸收的氨基酸等小分子物質的過程。因此，豆子煮熟后直接作為基肥施用到土壤中或直接進行穴施，因為其養分含量高，尤其是含氮量高，給微生物的繁殖提供了極好的食物，微生物大量繁殖，促使煮熟的豆子在土壤中快速發酵，產生較多的氨氣等有害氣體和熱量。即使穴施時拌勻了，煮熟的豆子仍然與蔬菜根系距離很近，容易造成燒根，影響蔬菜生長。因此，煮熟的豆子還應經過發酵腐熟，才能直接當作基肥施加。
那么，讓豆子發酵腐熟迅速有什么方法呢？將豆煮熟，殺死其中的微生物，豆中含水量非常多，可以在里面加入肥力高、發糞寶等發酵劑，堆悶一周左右，促進豆子盡快腐熟。如果菜農急于將煮熟的豆子作為基肥施用到土壤中，可先將豆子與生物菌肥按照2:1的量混勻，然后施用到15厘米左右的土層處，以促進豆子的發酵腐熟，避免豆子與根系近距離接觸。
如果已經當作基肥施用到地里并出現了燒根植株，菜農應及時澆水，地表見干后及時劃鋤，促進有害氣體和熱量散失，減輕其為害。如果棚內燒根嚴重，出現大量死苗，只能拔掉重新定植，但重新定植前應深翻土壤，促進豆子與土壤混勻，并閉棚提溫2-3天，以促進土壤中的熟豆子盡快發酵腐熟，同時加大通風力度，將棚內的有害氣體排出棚外。定植時與原來的定植穴錯開定植。
除了熟豆子外，還有不少菜農習慣將大豆榨油后的殘渣（豆餅）不經發酵腐熟直接施入土壤，也易導致燒根、熏苗現象的發生。在此，記者提醒菜農朋友，在使用煮熟的豆子、豆餅、食用菌廢料及成袋的干雞糞（有些干雞糞已腐熟）作基肥或穴施時，一定要先發酵腐熟才行。