果園秋季施肥，是改良土壤、提高樹體養分、養好花芽的必要措施，應該在立秋后至落葉前盡早進行。但不少人，尤其是種植晚熟品種的人，擔心施肥會損傷根系，因此遲遲不動手，一定要等到采果后才施肥，且美其名曰“月子”肥。
秋季施肥，勢必會對根系造成損傷，這種損傷對樹體和果實有沒有影響？斷根，究竟是好處多還是壞處多？有必要認真進行一番探討。
首先說斷根對果樹和果實有沒有影響。在果樹學上，一般認為只要有一部分根系能夠吸收養分，就能滿足樹體的需求。秋施基肥斷根的數量畢竟有限，不可能損傷所有的根系，因此可以認定部分斷根，不會對果樹和果實造成不良影響，另外，近年來很多效益很高的果園，都實行的是行間開溝施肥，且大都在9月份進行，實踐證明，并沒有影響到果樹的發育和果實的品質。
再說斷根是好處多還是壞處多。可以肯定地說，秋施基肥斷根只有好處沒有壞處。
一方面，秋季正是根系發育的高峰期，傷根容易愈合。另一方面，斷根相當于對根系進行修剪，其修剪反應和樹上短截一樣，在傷口下會長出大量的新根，原來的一條老根變成了十多條新根。根系數量增加了，根系“返老還童”了，來年吸收養分的能力自然就會增強。
果樹的根系是分級次的。原來的老根已經進化為輸導根，輸導根的作用主要是輸送養分。斷根后新長出的根叫生長根，生長根是吸收根的母根。也就是說，下一年的吸收根主要在生長根上不斷長出來。吸收根壽命很短，一般不會超過一個月，只有生長根上才能源源不斷地長出吸收根來，不至于出現吸收根大量死亡、樹上養分接續不上的現象。生產上很多果樹的階段性缺素癥其實就與吸收根階段性缺失緊密相關。
中國科學院院士、著名果樹專家束懷瑞等權威人士認為，樹體衰老一般先從根系開始，根系修剪更新有著和地上部枝條修剪同樣重要的意義。在實際生產中，主要挖通壕施基肥，或者挖放射溝，暴露出大量的根，這時應當改變過去盡量少傷根的觀念，而對其進行有目的的修剪。根系光禿嚴重的，可疏大根或短截中等粗度的根，刺激在根基部傷口處發根。根系分支少的，要適當短截促發分枝。尤其是在黏土地，根的單軸延伸能力強，短截效果。
由此看來，秋季施肥果樹斷根好處不少，完全不必要擔心造成根系損傷。