現狀：目前菌肥沒有被大面積推廣施用，根本原因在于普遍農戶思維陳舊對菌肥認知度明顯不足，再有就是菌肥市場不夠規范！對于菌種真假難辨！如對菌肥之功效、養分含量、施肥方法的掌握較生疏，就很難達到理想的效果。下面咱們就談談菌肥的正確施用和相關問題：
1.菌肥有什么作用
菌肥是微生物肥料的俗稱，它是一種帶活菌體的輔助性肥料。土壤中存在著大量的微生物（包括細菌、真菌、放線菌），一般每克土含有幾億至幾十億個微生物。有些對作物生長發育有益，有些則有害。人們用科學的方法從土壤中分離、選育有益微生物，經過培養、繁殖、制成菌劑，將這些菌劑應用于農業，使作物增產，稱為菌肥。目前我國生產和應用的菌肥主要有根瘤菌、固氮菌、磷細菌、鉀細菌、EM菌肥料等。菌肥是通過有益微生物的生命活動，拮抗有害微生物，促進土壤中養分的轉化，提高土壤養分的有效性，改善作物營養條件，增加土壤肥力。
菌肥的作用有一下幾方面：
1.1改善土壤養分供應狀況
菌肥主要通過各種菌劑促進土壤中難溶性養分的溶解、釋放。菌劑在代謝過程中釋放出大量的無機有機酸性物質，促進土壤中微量元素硅、鋁、鐵、鎂、鉬等的釋放及螯合，有效打破土壤板結，促進團粒結構的形成，使被土壤固定的無效肥料轉化成有效肥料，改善了土壤中養分的供應情況、通氣狀況及疏松程度。
1.2促進作物生長
菌肥的使用，促進了刺激素的產生，調節、促進作物的生長發育。菌劑的使用，可以促進赤霉素、生長素和其他活性物質的產生。
1.3增強作物抗病抗逆能力
菌肥中部分菌種具有分泌抗菌素和多種活性酶的功能，抑制或殺死致病真菌和細菌；大量的田間試驗證明，菌肥的應用可以降低病蟲害發生率及增強作物的抗逆性能。如對棉花黃枯萎病，稻瘟病，小麥的白粉病、莖腐病，蔬菜猝倒病、立枯病、青枯病等有一定的防治和抑制作用，大量實驗表明地恩地微生物菌劑可有效抑制某些種類線蟲病的發生。菌肥還有明顯的抗旱、耐寒、抗倒伏、抗鹽堿的效果，增強作物的抗病性，從而有效預防作物生理性病害的發生。
1.4提高產量、改善品質
使用微生物肥料可以提高農產品中的維生素C、氨基酸和糖分的含量，有效降低硝酸鹽含量，使生產出來的農產品好吃又好看，賣個好價錢。可不同提高作物產量20-30%.
2.菌肥的正確施用
菌肥用量少，單施不易施勻，覆土之前易受陽光照射影響效果，遇風天還會發生被風吹跑，可與有機肥混合深施效果較好，也可以與營養土混合用于蔬菜育苗，也可在蔬菜定植時穴施或溝施。
（1）菌肥肥效持續時間長。由于生物菌具有較強的生命力，一般肥效可達150~180天，一季作物只施用一次，即可滿足作物一生的生長發育的要求。
（2）菌肥是一種活性菌，施用時必須埋于土壤中，不能撒施于地表，一般深施7~10cm.由于生物菌對作物的根系和種子不造成任何傷害，所以菌肥施用時應限度地靠近作物根系，讓其與作物根系限度地接觸，才能充分發揮生物菌肥的肥效。作種肥時，施于種子正下方2~3cm處；作追肥時盡量靠近根系為好；葉面噴施時，應在下午3時后進行，并噴施于葉的背面，防止紫外線殺死菌種。
（3）菌肥與其它肥料配合施用效果好。菌肥是一種高含菌量的生物制劑，施于土壤后需要15~20天才能發揮肥效，多數生物菌需在氮元素的作用下才能復蘇，所以在施菌肥時要適量地配合少量的氮肥，一般每公頃施復合菌肥25~30kg，且根據不同情況，配合施用45~75kg尿素、75kg磷酸二銨。如與有機肥料配合施用（每公頃配施商品有機肥80kg），可加快改善土壤的理化性狀，增加土壤有機質的含量，提高生物菌的活性。
（4）保持土壤適宜的溫濕度條件：菌肥在土壤持水量30%以上、土壤溫度在10~40℃、pH值在5.5~8.5的土壤條件下均可施用。在土壤持水量小于30%時要及時澆水，并及時中耕松土以保持土壤墑情、提高土壤溫度。
（5）配制營養土：一般取田園土（無農藥污染的田園土）60kg，充分發酵腐熟的人、畜、禽糞便30kg，加復合菌肥10kg，充分攪拌均勻即可。該營養土可用于農作物、蔬菜、瓜果、果樹等育苗、養苗等使用。
3.施用及推廣中應注意事項
生物菌肥起關鍵作用的是菌種，但菌種又是看不見摸不著的，如何判斷一種生物菌肥的優劣？
首先要看有沒有農業部登記證，獲得農業部登記證的菌肥才可能是真正的；
其次要看品牌的持續性，一般來說品牌持續時間越長，可信度越高；
第三點就是經營者必須親自做試驗。有了這三點基本就能判斷出菌肥的優劣。
此外，在施用過程中應注意以下幾點：
3.1有效期及有效活菌數
目前我國微生物肥料有效菌存活時間超過1年的不多，所以選購的菌肥要盡快使用，存放時間過長，其菌種的休眠狀態可能被破壞。菌肥有效活菌數達不到標準的菌肥不能購買。國家規定微生物菌劑有效活菌數≥2億/克（顆粒1億/克），復合微生物肥料和生物有機肥有效活菌數≥2000萬/克。如果達不到這一標準，說明產品質量達不到要求。
3.2溫濕度、土壤及施用時期
施用菌肥的溫度是25℃~37℃，低于5℃，高于45℃，施用效果較差。對高溫、低溫、干旱條件下的農作物田塊不宜施用。固氮菌肥適濕度土壤的含水量是60%~70%.對含硫高的土壤和銹水田，不宜施用菌肥，因為硫能殺死生物菌。對于翻漿的水田，一般不用撒施，用噴霧的方法效果會好些。生物菌肥不是肥，在作物的營養臨界期和營養大量吸收期前7~10天施用，效果。
3.3用量及混用
土壤中施入較多的菌肥，雖然不會出現燒根燒苗現象，但也并不是施得越多就越好。盲目大量施用生物菌肥，會增加肥料投入成本，降低作物的栽培效益。
因此，應根據不同作物的需要和土壤養分狀況，科學地確定生物菌肥施肥量，才能達到增產增收的目的。
菌肥可與化肥混合使用。如過磷酸鈣等施入土壤后易被固定，與菌肥混合施用，可減少養分固定、流失。而且單獨施用較大量的化肥或化肥施用不均勻時，容易對作物產生毒副作用，如果與菌肥混合施用，則會減少此類問題發生。但不要將菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑和含硫的化肥（如硫酸鉀等）以及稻草灰混合用，因為這些藥、肥，很容易殺死生物菌。或者先施菌肥，隔48小時后，再打藥除草。若拌種切忌和已拌好殺菌劑的種子混合使用。千萬防止與未腐熟的農家肥混肥。