化肥是農業生產的基本投入之一。然而在使用的過程中卻存在一些問題，所以農業專家提醒，農戶們有必要弄清楚化肥使用中常見的一些問題。
01、偏施問題
作物生長發育必需的營養元素有16種，包括大量元素和微量元素。作物對某種元素無論需要量是大是小，在“必需”這一點上都是同等的，也是不能相互代替的。在實際生產中，常常誤認為化肥就是氮肥、磷肥，只要大量施用氮肥、磷肥就能增產，這是不對的。正確地施肥應該是土壤缺什么元素就施含什么元素的肥料。土壤缺氮素，就應補充氮肥。土壤缺鉀，就應補充鉀肥，不能以磷肥代替鉀肥，也不能因為多施氮肥就少施磷肥？傊斖寥廊狈δ承┰貢r，就應該增施含相應元素的肥料，也不能以大量元素肥料代替中量或元素肥料。
02、盲目施用問題
由于化肥在作物增產方面效果非常明顯，所以使很多人誤解為不論施用什么化肥都一定能增產。這也是使用化肥的一個誤區。我們在施肥時，一般情況下，這種養分指大量元素，但并不排斥微量元素成為需要養分的可能性。盲目施肥還表現在施肥量上。在生產中，常有很多人不注意研究施肥量與產量的關系，一味盲目地大量施肥，從而出現“增產不增收”的現象。
03、肥料配合問題
化肥與有機肥相結合，是農業施肥的重大發展。但是，目前由于農民比較重視眼前利益，化肥又具有比較方便于儲存、運輸、施用的特點，增產又比較迅速，所以生產中偏施、單施化肥而忽略有機肥的現象越來越嚴重。我國農民有堆積和施用有機肥的傳統習慣。有機肥的許多優越性往往是化肥所沒有的，比如，人畜糞便家家都有，取材方便又不用花錢。有機肥的施用，也是土壤培肥和建立高產、穩產農田的重要途徑。另外應當指出的是，肥料配合也包括各種化肥間的配合，這種配合施肥的增產效果要好于單施某種化肥的效果，這已被大量的試驗所證明。
04、對土壤影響問題
有人認為施用化肥會引起土壤板結、肥力下降，這是使用化肥的又一個誤區。不能單純的認為長期使用化肥會引起土壤板結。大量的試驗結果證明，只要各種化肥適當配合使用，就不會降低土壤肥力，也不會引起土壤理化性質的惡化，導致土壤板結。農業專家提醒，農戶在實際生產中，要經濟有效的施用化肥，提高化肥的肥效，獲得農作物的高產、穩產，就應該先從合理分配和科學施用化肥入手。