磷肥施用對農作物的生長也有很大的好處，根據土壤供磷能力，掌握合理的磷肥用量。土壤有效磷的含量是決定磷肥肥效的主要因素。一般土壤有效磷（P）小于5mg/kg時，為嚴重缺磷，氮磷肥施用比例應為1：1左右；有效磷（P）含量5-10mg/kg時，為缺磷，氮磷肥施用比例應為1：0.5左右；有效磷（P）含量10-15mg/kg時，為輕度缺磷，可以少施或隔年施用磷肥。
掌握磷肥在作物輪作中的合理分配。小麥、玉米輪作時，磷肥主要投入在小麥上作基肥，玉米利用其后效。豆科作物與糧食作物時，磷肥重施于豆科作物上，以促進其固氮作用，達到以磷增氮的目的。
注意施用方法。磷肥施入土壤后易被土壤固定，且磷肥在土壤中的移動性差，這些都是導致磷肥當季利用率低的原因。為提高其肥效，可用開溝條施、穴施，同時注意在做基肥施時上下分層施用，以滿足作物和中后期對磷肥的需要。
配合施用有機肥、氮肥、鉀肥等。與有機肥堆漚后再施用，能顯著地提高磷肥的肥效。但與氮肥、鉀肥等配合施用時，應掌握合理的配比，具體比例要根據對土壤中氮、磷、鉀等養分的化驗結果及作物的種類確定。