薄皮甜瓜的生長周期很短，所以應該及時的施加肥料，我們要選擇基肥進行施加，要確保充足的基肥，后期的追肥也要及時。
一般每畝應施入20立方米發酵好的雞糞或牛糞，或施入300公斤優質商品有機肥。另外，還要施用硫酸鉀型復合肥100公斤、純鉀肥30公斤，同時加入硼、鋅等微量元素肥料。
追肥要巧甜瓜果實長到雞蛋大小時，應及時追肥，可結合澆膨瓜水沖施膨瓜肥。膨瓜期追肥澆水是甜瓜高產優質的關鍵措施。甜瓜是喜鉀作物，可結合澆膨瓜水給甜瓜補充高氮高鉀肥料；甜瓜后期對鉀元素需求量較大，增施鉀肥可明顯提高甜瓜的產量和品質。另外，對出現旺長的植株應適當控施氮肥。
微肥要補植株表現出缺素癥狀時，應仔細鑒別，沖施或噴施相應的微量元素肥料。坐瓜后，結合澆水用0.3%的氯化鈣加0.12-0.25%的硼酸混合液進行葉面噴施，每隔7天噴1次，連噴2-3次，以補充甜瓜植株所需。
合理對薄皮甜瓜進行施肥及追肥能是甜瓜長的又大又甜，這樣無論是在口感上，還是在產量上都很好，從而增加自己的經濟利益。