水稻所必需的微量元素在其中都起著非常重要的作用，是水稻所不可缺乏，不可替代的，我們要施加水稻微肥的質量，否則會造成水稻的減產。
對于作物來說，含量介于0.2-200mg/kg（按干物重計）的必需營養元素稱為“微量元素”。到目前為止證實作物所必需的微量元素有鋅、硼、錳、鉬、鐵、銅、氯等七種。對水稻而言，施肥鋅硅很重要。在水稻的優化配方施肥中，人們往往十分重視氮、磷、鉀等大量元素化肥的配合施用，卻忽略了硅、鋅等元素的施用。事實上，水稻是吸收硅較多的作物，一般莖葉中含有二氧化硅10%-20%，水稻體內硅酸含量約為氮的10倍，磷的20倍左右。水稻缺硅，容易導致莖稈細長軟弱，易倒伏和感染病害，前期缺硅使水稻成穗數減少，后期缺硅則小穗數減少，水稻的優質高產就沒有。水稻施用硅肥，能增強水稻對病蟲害的抵抗能力和抗倒伏能力，改善株型，提高光能利用率，減少葉面蒸騰失水，提高水分利用率。一般可增產10%以上，并能提高稻米品質。特別是在新改水田、冷浸田以及酸性土壤上，水稻施用硅肥的效果更為明顯。鋅雖然僅僅只是一種微量元素，但對水稻、玉米等喜鋅作物作用很大，增產效果很好。水稻對鋅元素非常敏感，缺鋅會導致植株出葉緩慢，新葉短而窄小，葉色較淡，特別是基部中脈附近褪成黃白色，嚴重的植株明顯矮化叢生，很少分蘗，田間常表現參差不齊，稻株根系老朽，呈褐色，抽穗期出現“揚花不收”，一般減產10%-30%，嚴重田塊甚至毀苗絕收。大面積實驗結果表明，合理施鋅后，水稻株高、有效分蘗數、每穗粒數、千粒重都有增加，空秕率有所降低，一般可增產15%以上。特別是在酸性土壤、石灰性土壤以及冷浸田、新改水田施用鋅肥作用則更為明顯。具體施用方法是：（1）硅肥施用。多利用含有鈣、鎂的硅酸鹽作硅肥，在施用基肥時與其它肥料混合施入，每畝施用量為有效硅1公斤。（2）鋅用施用。一般提倡作基肥施用，畝施硫酸鋅1公斤，與其它化肥混合施入；也可作根外施肥、中后期土壤追肥及種子處理等。根外追肥常用濃度為0.3%硫酸鋅，后期追肥為施硫酸鋅0.5公斤左右，都在缺鋅癥狀出現后或分蘗末期進行，種子處理則用0.1%硫酸鋅浸稻種24小時即可。
施加水稻微肥不能盲目的施加，應當了解水稻的基本情況，如長勢，地勢，天氣等方面的因素從而決定施加微肥的方式，這樣才能夠起到很好的效果，如果只是盲目的施加，不僅到沒有好的收成，而且嚴重時導致絕產，利益損失慘重。