夏季里高溫多雨，因此番茄病害較多多，敗秧嚴重。為確保番茄越夏，有利秋季二次結果，在越夏期間，應采取“兩改、三及時”管理措施，防止敗秧，同時要合理的施加肥料。
一、改栽培方式。為防治夏季雨水浸種，應改平畦為垅栽。若已在平畦栽植，可結合培土，分次使畦心變為垅背，使壟背變為畦心。一般應分2至3次培土完成，防止一次培土過量，影響根系吸收化肥的能力。培土后，根量增加，吸收養分能力加快，植株健壯，增強抗病力。由于根系上下層分布均勻，可減少地表溫度變化時對根系的影響，有利壯秧抗逆。
二、改整枝技術。為使番茄越夏不敗秧，應改傳統的單干式或雙干式整枝法為新的偏心摘頭整枝技術。新的整枝方法是：當花序或第二花序坐果時，第二花序或第三花序出現，在第二花序下長出的個側芽代替主干，同樣使其著生兩個或三個花序后，在主干中部選一側芽培養為主干。如此連續摘心換頭，有刺激植株更新生長的作用，使植株越夏不敗秧，坐果多，產量高。
(1)及時供水肥。盛夏炎熱，及時供給番茄水肥，是防治敗秧的重要措施。田間忽干忽濕，雨后積水，則會造成大量死秧。因此，田間土壤濕度要基本保持一致，一般7天左右澆水一次。在及時供水的同時，還應隔15至20天追施一次尿素或硝銨等性氮肥，每畝追施5公斤左右，與此同時，還應葉面噴施磷酸二氫鉀，使植株壯苗不徒長。
(2)及時防病蟲。番茄越夏期病害主要有疫病和病毒病。對疫病應隔10至15天噴一次1：1多菌靈和代森鋅500倍混合液，或噴1：1甲基硫菌靈和瑞毒霉800倍混合液，二者交替噴施效果更好。對病毒病可及時噴施40％樂果乳劑1500至2000倍液消滅蚜蟲，以防傳播。在發病前，每隔7至10天噴一次0．1至0．3％的高錳酸鉀液，可防病毒病發生。越夏期間危害番茄的害蟲主要有棉鈴蟲、玉米螟等鉆蛀危害，造成植株死亡。在它們產卵高峰期，及時噴打樂果、敵百蟲、菊酯類殺蟲劑，可防止為害。
(3)及時排積水。番茄喜濕潤，怕水浸。高溫季節，澆水要在早晚涼爽時隨澆隨排，降低地溫，減少病害。特別是雨后積水，會窒息根系，或誘發青枯病發生。