化肥農藥混搭使用時，藥效肥效均要得以發揮，既不能影響藥肥的理化性質，又不能對作物產生有害影響。
一般來說，固體農藥化肥直接混用，其要求不甚嚴格，而托布津、井岡霉素、葉蟬散、速滅威等均不能與碳銨、氨水、草木灰、石灰氮等混合使用。堿性強的農藥，如石硫合劑、波爾多液及松脂合劑等不能與磷酸鈣、硫酸銨、硝酸銨、氯化銨等化肥混合使用，含砷農藥不能與鈉鹽、鉀鹽類肥料混用。
農藥與農藥混用也易產生藥害，如：敵稗和有機磷殺蟲、殺菌劑或氨基甲酸酯殺由劑混用，由于有機磷或氨基甲酸酯抑制水稻體內分解敵稗的酰胺水解酶的作用，而使水稻發生藥害。敵稗或滅草靈不僅不能與有機磷、氨基甲酸酯殺蟲劑混用，也不能前后相接使用，否則對水稻易產生藥害。
在柑橘上敵菌丹與乳劑類農藥混用，易增加藥害。
在梨樹上多果定和乳劑類農藥混用，會增加藥害。在蔬菜上滅螨錳及同類和代森鋅或代森環等混用，也易發生藥害。單劑使用易產生藥害的藥劑，若摻合乳劑類藥劑，則有加重藥害的傾向，溴氰菊酯(敵殺死)與有機磷農藥混用，會增加對農作物的藥害。苯并咪唑類農藥不能與含銅的農藥混用，否則會對作物產生藥害。波爾多液與石硫合劑混用，對植物易產生藥害，有機磷農藥與松脂合劑混用，對作物易產生藥害。